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結合双生児の分離は二重結果論的にはどう判断されるんだろうと思って検索したらいいサイトが見つかった。

これは片方が比較的健康でもう片方が明らかに健康ではないケースだったから親の同意を得ない分離手術が認められた。2人とも同じくらい健康な場合はまた判断が変わってくる。赤ん坊や幼い子どものうちに周囲が生命の選別について決定しなければいけない場合は重大な問題になる。

これと反対に、結合したまま命に別状なく成人したが、2人の強い意向によって分離手術を行い、2人とも死亡した例もある。
http://www5d.biglobe.ne.jp/~nikkan/shamusuuseiji.htm
結合双生児は多くの場合で分離手術を行わないほうが身体に負担が少ないそうだ。それでも成人していれば当人たちの意思を最優先できる。